Повсеместно встречается в реках и озерах системы Бии, Телецком озере и реке Чулышман. Водится в бассейне Катуни несколько выше рек Майма и Иша, в речках и озерах Бие-Чумышской возвышенности и Приобского плато. В высокогорных водоемах Горного Алтая окунь отсутствует. Препятствием являются быстрые водотоки, пороги и водопады.

Весной в реках окунь выходит в пойму для нереста. Нерест в равнинной части края наступает в начале мая.

Хозяйственное значение небольшое, объект любительского лова. Добывают неводами, сетями, мордами, корчажками, вентерями. Любители летом и зимой могут успешно использовать для лова окуня крючковую снасть, летом поплавочную удочку с естественной или искусственной приманкой, также перемет. Зимой окунь берется на зимние блесны, крупных личинок комара-толкунца, живого или вареного бокоплава (мормыша).