В бассейне Оби обитает на всем протяжении от устья до Бии и Катуни, образуя локальные стада в ее притоках. После перекрытия Оби плотиной Новосибирской ГЭС в 1957 г., сохранилась небольшая часть верхнеобского стада выше водохранилища в Оби. В Бие поднимается до ее среднего течения, а в Катуни - до Манжерок, заходит в Чарыш. Молодь изредка встречается и в пойменных водоемах (окрестности Барнаула).

В последние предвоенные годы улов нельмы в Оби был довольно высоким. Даже в начале 50-х годов она была обычной промысловой рыбой и добывалась неводами на Бийском и Мало-Угреневском рыбопромысловых участках реки Бия (Аршинов, 1959). В 60-е годы нельма попадалась в невода рыбакам в среднем течении Бии. За последние 30-35 лет известны лишь единичные случаи добычи небольших нельм в нижнем течении Катуни.

Начало хода нельмы на нерест весной в мае. В низовьях Катуни первое движение к местам нерестилищ весной в мае.

Нельма как редкая рыба, включена в Красные книги Республики Алтай (1996) и Алтайского края (1998).